Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP36Q96EU6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms