Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms