Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSUN4Q96CB9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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