Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF428Q96B54 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms