Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C1Q96A29 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms