Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKL1Q969V6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKL1Q969V6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms