Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms