Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms