Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSC1Q92574 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms