Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCAF4Q8WV16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCAF4Q8WV16 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms