Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC7Q8WUI4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC7Q8WUI4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms