Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms