Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms