Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD1Q8NHV4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms