Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms