Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG8Q8ND04 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG8Q8ND04 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms