Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD1Q8NBU5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD1Q8NBU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms