Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPC24Q8NBT2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms