Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms