Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CHCHD4Q8N4Q1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CHCHD4Q8N4Q1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CHCHD4Q8N4Q1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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