Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC2Q8N158 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms