Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms