Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms