Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST3Q7LGC8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms