Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX8Q6ZV50 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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