Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPGS1Q6ZTW0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms