Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms