Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms