Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPNTQ6UXI9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPNTQ6UXI9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms