Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ABRAXAS1Q6UWZ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms