Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFTA2Q6UW10 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms