Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms