Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF7Q6Q0C0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF7Q6Q0C0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms