Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LARP1Q6PKG0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms