Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC70Q6NSX1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms