Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GGNBP1Q5YKI7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms