Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CARMIL1Q5VZK9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CARMIL1Q5VZK9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms