Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF3Q5VWG9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms