Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms