Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR78Q5VTH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms