Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms