Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP1Q5VSL9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms