Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf60Q5U649 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms