Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIVEP3Q5T1R4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIVEP3Q5T1R4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms