Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN11Q5T124 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms