Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CELF3Q5SZQ8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms