Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC158Q5M9N0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms