Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMPK2Q5EBM0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms