Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD39Q53RE8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms