Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC44A4Q53GD3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms